Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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FXNQ16595 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FXNQ16595 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FXNQ16595 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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FXNQ16595 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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