Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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