Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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