Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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PTP4A2Q12974 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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PTP4A2Q12974 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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PTP4A2Q12974 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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PTP4A2Q12974 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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PTP4A2Q12974 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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