Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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