Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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