Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms