Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MIS18AQ9NYP9 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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