Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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