Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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