Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NME3Q13232 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms