Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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