Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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STRN3Q13033 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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