Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCCD1P59942 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MCCD1P59942 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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