Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DTX3Q8N9I9 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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