Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
USF2Q15853 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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