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| RUNX3 | Q13761 | AC099060.1-201 | ENST00000427806 | 448 nt | TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011242.1-201 | ENST00000433596 | 1158 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P52-201 | ENST00000433928 | 531 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL360013.2-201 | ENST00000440104 | 807 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035551.1-201 | ENST00000446931 | 348 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121718.1-201 | ENST00000449463 | 387 nt | TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL669942.2-201 | ENST00000620352 | 697 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC090772.4-201 | ENST00000623599 | 362 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4G3P-201 | ENST00000633500 | 913 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRIT3-202 | ENST00000594814 | 3566 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PARP8-201 | ENST00000281631 | 7177 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RFX7-201 | ENST00000559447 | 10426 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MS4A1-201 | ENST00000345732 | 3331 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC074029.4-201 | ENST00000624796 | 1859 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | STK31-205 | ENST00000433467 | 3085 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021355.1-202 | ENST00000519996 | 1633 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AJ009632.2-202 | ENST00000634644 | 1513 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GCSAML-203 | ENST00000366491 | 4130 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-354P-201 | ENST00000383862 | 107 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-610P-201 | ENST00000384264 | 107 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1257P-201 | ENST00000384625 | 110 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097717.1-228 | ENST00000417006 | 754 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4P11-201 | ENST00000417020 | 1058 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01347-201 | ENST00000417964 | 355 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC114814.2-201 | ENST00000419195 | 485 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004870.4-201 | ENST00000424359 | 360 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP32-201 | ENST00000427945 | 1084 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161640.1-201 | ENST00000429507 | 390 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P4-203 | ENST00000430239 | 730 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022022.1-201 | ENST00000430304 | 178 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC021205.1-201 | ENST00000468797 | 348 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LINC02325-201 | ENST00000499910 | 1115 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NUDT6-203 | ENST00000502270 | 678 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RFESD-208 | ENST00000513950 | 464 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYLK-AS2-202 | ENST00000515464 | 754 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP13-201 | ENST00000515933 | 244 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009435.1-201 | ENST00000519555 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084706.1-201 | ENST00000521879 | 558 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIRREL3-AS2-201 | ENST00000532988 | 492 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02423-202 | ENST00000542577 | 460 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATF7IP2-206 | ENST00000543967 | 998 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | YWHAZP1-201 | ENST00000556286 | 722 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFAND6-208 | ENST00000558688 | 780 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SULT1C2P2-201 | ENST00000562517 | 294 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC127502.1-204 | ENST00000564861 | 618 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090403.1-205 | ENST00000580883 | 516 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DSCR9-205 | ENST00000585273 | 751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005131.3-201 | ENST00000590042 | 665 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02565-201 | ENST00000592678 | 478 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091057.3-201 | ENST00000602684 | 733 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355376.2-201 | ENST00000603866 | 267 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008759.3-201 | ENST00000613300 | 508 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL050303.3-201 | ENST00000613704 | 284 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5H6-201 | ENST00000615035 | 1113 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011472.4-201 | ENST00000615848 | 491 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022960.3-201 | ENST00000619794 | 441 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079684.1-201 | ENST00000621405 | 437 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093875.1-201 | ENST00000623688 | 504 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445984.1-201 | ENST00000637834 | 659 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5H6-202 | ENST00000641416 | 1032 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GLCE-202 | ENST00000559420 | 4840 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM126A-204 | ENST00000432176 | 13177 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTX3-203 | ENST00000512560 | 4799 nt | TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |