Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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