Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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TCOF1Q13428 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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