Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms