Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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