Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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