Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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