Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms