Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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