Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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RUNX3Q13761 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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RUNX3Q13761 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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RUNX3Q13761 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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RUNX3Q13761 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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