Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CUL3Q13618 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CUL3Q13618 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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CUL3Q13618 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CUL3Q13618 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CUL3Q13618 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CUL3Q13618 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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