Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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