Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DUSP4Q13115 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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