Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD13P35453 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms