Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms