Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMIM3Q9BZL3 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms