Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNS3Q9BQ31 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms