Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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