Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms