Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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CDH18Q13634 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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CDH18Q13634 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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CDH18Q13634 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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CDH18Q13634 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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CDH18Q13634 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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CDH18Q13634 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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