Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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