Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uso1Q9Z1Z0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uso1Q9Z1Z0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uso1Q9Z1Z0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uso1Q9Z1Z0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uso1Q9Z1Z0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uso1Q9Z1Z0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uso1Q9Z1Z0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms