Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms