Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb6Q9Z0T9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms