Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sept6Q9R1T4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms