Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms