Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms