Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms