Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms