Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Six6Q9QZ28 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms