Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tomm40Q9QYA2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tomm40Q9QYA2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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