Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms