Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms