Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms