Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms